Приказом Министра обороны Российской Федерации от 15 марта 2012 года № 545 образован новый филиал Академии - Военно-морской политехничесий институт. В него вошли бывшие филиалы г. Пушкин (Военно-морской инженерный институт) и г. Петродворец (Военно-морской институт радиоэлектроники).